Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Htatsf1Q8BGC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Htatsf1Q8BGC0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms