Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm2Q8BGA3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms