Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efr3aQ8BG67 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efr3aQ8BG67 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms