Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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H2-M10.4Q85ZW8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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H2-M10.4Q85ZW8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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H2-M10.4Q85ZW8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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H2-M10.4Q85ZW8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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H2-M10.4Q85ZW8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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