Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc50Q810U5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc50Q810U5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms