Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem39bQ810L4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms