Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Smim19Q80ZU4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim19Q80ZU4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim19Q80ZU4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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