Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cracr2bQ80ZJ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms