Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV3

Trrap, Transformation/transcription domain-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrrapQ80YV3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TrrapQ80YV3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TrrapQ80YV3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TrrapQ80YV3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms