Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm5bQ80Y84 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm5bQ80Y84 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5bQ80Y84 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms