Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Otop3Q80UF9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otop3Q80UF9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Otop3Q80UF9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms