Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
NischQ80TM9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
NischQ80TM9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
NischQ80TM9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NischQ80TM9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
NischQ80TM9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
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