Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdc42bpbQ7TT50 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms