Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp6r1Q7TSI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp6r1Q7TSI3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms