Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dsg1cQ7TSF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dsg1cQ7TSF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dsg1cQ7TSF0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms