Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ckap2lQ7TS74 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ckap2lQ7TS74 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms