Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prrc2bQ7TPM1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prrc2bQ7TPM1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms