Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp397Q7TNK4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp397Q7TNK4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms