Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rpf1Q7TND5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rpf1Q7TND5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms