Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd2Q7JJ13 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd2Q7JJ13 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms