Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmed3Q78IS1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed3Q78IS1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms