Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GypcQ78HU7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GypcQ78HU7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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