Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eapQ76KJ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd3eapQ76KJ5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms