Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2d2bQ6ZWY6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ube2d2bQ6ZWY6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms