Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ncapd3Q6ZQK0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms