Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Topbp1Q6ZQF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Topbp1Q6ZQF0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Topbp1Q6ZQF0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Topbp1Q6ZQF0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms