Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chsy1Q6ZQ11 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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