Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M2Q6W9L1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M2Q6W9L1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M2Q6W9L1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms