Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc88cQ6VGS5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc88cQ6VGS5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms