Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc9c1Q6UJY2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc9c1Q6UJY2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms