Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd300lfQ6SJQ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd300lfQ6SJQ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms