Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2b4Q6Q477 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2b4Q6Q477 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2b4Q6Q477 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms