Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NfrkbQ6PIJ4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfrkbQ6PIJ4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfrkbQ6PIJ4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms