Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc82Q6PG04 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc82Q6PG04 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms