Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmeff1Q6PFE7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms