Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SvoplQ6PDF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SvoplQ6PDF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SvoplQ6PDF3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms