Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mfsd4aQ6PDC8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4aQ6PDC8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms