Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Slf2Q6P9P0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slf2Q6P9P0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms