Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam222bQ6P539 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam222bQ6P539 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam222bQ6P539 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms