Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atg2aQ6P4T0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2aQ6P4T0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms