Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik3Q6P4S6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms