Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Soga3Q6NZL0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Soga3Q6NZL0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Soga3Q6NZL0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms