Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SphkapQ6NSW3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SphkapQ6NSW3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SphkapQ6NSW3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms