Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg16l2Q6KAU8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg16l2Q6KAU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg16l2Q6KAU8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms