Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn11Q6J756 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Capn11Q6J756 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms