Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParpbpQ6IRT3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ParpbpQ6IRT3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ParpbpQ6IRT3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms