Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Arhgap20Q6IFT4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Arhgap20Q6IFT4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap20Q6IFT4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms