Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Hecw2Q6I6G8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Hecw2Q6I6G8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hecw2Q6I6G8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms