Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Cep290Q6A078 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Cep290Q6A078 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Cep290Q6A078 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Cep290Q6A078 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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Cep290Q6A078 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Cep290Q6A078 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep290Q6A078 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Cep290Q6A078 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Cep290Q6A078 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Cep290Q6A078 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Cep290Q6A078 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep290Q6A078 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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