Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cep170Q6A065 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cep170Q6A065 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cep170Q6A065 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
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